204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0076 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0076  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.668019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0165  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.94 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.364368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  51.57 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0111  RimK domain-containing protein ATP-grasp  49.81 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.19 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.17 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  33.16 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  26.7 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  26.7 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  33.71 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  30.85 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.14 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.58 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  27.53 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  32.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  30.3 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  26.77 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.26 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  31.52 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  30.59 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.91 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.63 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.54 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.88 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  28.9 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.32 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.8 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  30.06 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  28 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  28.92 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  28.92 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  25.15 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.03 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.91 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.57 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  32.26 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  28.93 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.88 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.14 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  27.65 
 
 		 456 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.05 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  28.9 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  28.14 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.06 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  28.9 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.63 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  28.32 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  28.32 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  28.32 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.32 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  28.07 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.3 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.29 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.35 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.32 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.32 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.32 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  27.65 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.34 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  27.44 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.9 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.23 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  28.14 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.22 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.41 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  30.17 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  28.22 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  24.7 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.82 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  24.7 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  27.91 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.1 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.48 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.61 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  29.63 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.61 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.67 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.79 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  25.91 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  42.7 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>