70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0696 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 512 aa  1043    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  23.41 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  22.14 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  22.95 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  23.14 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  24.74 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  24.48 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  23.82 
 
 		 402 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.35 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  23.51 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  21.97 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  23.27 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  22.59 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  22.74 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  22.29 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.78 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  21.78 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.67 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.41 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  21.97 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  27.4 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  21.97 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  20.9 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  24.44 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  21.8 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.15 
 
 		 405 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  24.64 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  21.99 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  21.97 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  26.34 
 
 		 382 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  22.22 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  22.28 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  20.39 
 
 		 460 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  22.61 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  22.25 
 
 		 1101 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  27.91 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  22.39 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.66 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  22.93 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  20.64 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  30.91 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  22.65 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  20.56 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  22.68 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  22.46 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  21.25 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  18.41 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  23.74 
 
 		 806 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  29.24 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  20.44 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  23.83 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  20.25 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  28.65 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  24.42 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  34.94 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  22.61 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  20.43 
 
 		 1186 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  20.93 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  22.22 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.35 
 
 		 932 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.46 
 
 		 931 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.14 
 
 		 468 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.15 
 
 		 933 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  22.78 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  24.27 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  29.31 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>