84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1839 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  34.92 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  36.42 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  31.49 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  33.95 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  31.05 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  28.78 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  30.51 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  29.1 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  29.48 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  26.46 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  28.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  29.1 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  34.42 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.38 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  28.8 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  27.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  26.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  26.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  29.38 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  27.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  26.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  27.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  31.29 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  28.65 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  28.3 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  28.74 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  22.09 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  27.67 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  29.31 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.22 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  25.39 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  23.12 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  24.68 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  26.09 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  27.32 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  25.89 
 
 		 229 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  26.32 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  29.5 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  27.87 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  24.24 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 		 185 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  24.14 
 
 		 178 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  25.42 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>