More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01595 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  100 
 
 		 398 aa  775    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  45.08 
 
 		 412 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  47.83 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  44.25 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  43.81 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  39.59 
 
 		 403 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  40.91 
 
 		 397 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  42.42 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  43.59 
 
 		 415 aa  259  9e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  41.36 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  38.68 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  39.34 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  29.38 
 
 		 428 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  26.58 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  27.99 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  29.02 
 
 		 401 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  28.86 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  26.18 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  26.25 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  26.25 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  26.25 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  26.25 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  26.25 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  26.46 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  26.06 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  25.75 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  25.38 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  28.9 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.97 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  25.88 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.71 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  28.98 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  29.18 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  28.42 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  23 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  25.88 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.56 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  25.75 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  26.17 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  26.02 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  25.39 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  25.39 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  25.39 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  25.81 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.29 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  24.02 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.82 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  30 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  24.87 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.34 
 
 		 627 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  28.39 
 
 		 622 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.07 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  26.8 
 
 		 449 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  26.11 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 431 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  28.43 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  25.37 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  24.93 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  29.35 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  24.35 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.65 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  24.34 
 
 		 453 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  24.35 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  26.26 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  26.97 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  28.21 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  23.59 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.68 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  27.03 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.68 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  28.3 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  27.06 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  25.8 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  26.69 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  26.69 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  26.93 
 
 		 456 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.69 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>