241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1881 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  94.4 
 
 
250 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  91.6 
 
 
250 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  90 
 
 
250 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  90.36 
 
 
250 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87.6 
 
 
250 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  87.2 
 
 
250 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  87.2 
 
 
250 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.86 
 
 
346 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  78.4 
 
 
250 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  78.4 
 
 
250 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  82.4 
 
 
250 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  78.8 
 
 
250 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  71.49 
 
 
259 aa  374  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  67.6 
 
 
346 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  75.6 
 
 
234 aa  361  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86 
 
 
319 aa  357  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  88.44 
 
 
227 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  70.48 
 
 
224 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  62.1 
 
 
224 aa  311  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  45.69 
 
 
255 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  48.31 
 
 
218 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  45.73 
 
 
264 aa  185  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  45.73 
 
 
254 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  45.73 
 
 
254 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  47.62 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  178  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  47.83 
 
 
235 aa  177  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  46.38 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  39.22 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  39.65 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  38.79 
 
 
235 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  43.75 
 
 
235 aa  166  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  39.22 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  43.48 
 
 
235 aa  161  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  43.94 
 
 
236 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  40.8 
 
 
243 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  37.68 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  41.9 
 
 
228 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 
238 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  40 
 
 
228 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  40 
 
 
228 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  40 
 
 
228 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  39.5 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  40.51 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  37.08 
 
 
246 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  43.3 
 
 
215 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  37.8 
 
 
227 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  39.89 
 
 
185 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  39.89 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  45.77 
 
 
181 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  39.71 
 
 
263 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  38.66 
 
 
198 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  39.33 
 
 
206 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  39.22 
 
 
341 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  38.89 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  37.56 
 
 
226 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  37.56 
 
 
226 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  37.56 
 
 
226 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.24 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.24 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  35.24 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  35.24 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  35.84 
 
 
226 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  37.24 
 
 
226 aa  132  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.09 
 
 
226 aa  132  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  36.82 
 
 
224 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  36.82 
 
 
224 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  36.82 
 
 
224 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  36.82 
 
 
224 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  36.62 
 
 
226 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  38.03 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  38.31 
 
 
214 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  39.3 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>