More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0018 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  100 
 
 		 573 aa  1165    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.04 
 
 		 599 aa  620  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.79 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.62 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.62 
 
 		 586 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  46.97 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.79 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.62 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  45.75 
 
 		 586 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  44.95 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.93 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  43.15 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  43.15 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  50.82 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.37 
 
 		 608 aa  333  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.56 
 
 		 628 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.13 
 
 		 600 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  34.88 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.62 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.83 
 
 		 639 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  35.69 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.3 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.04 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.16 
 
 		 605 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.17 
 
 		 594 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  35.02 
 
 		 614 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.7 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.3 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.21 
 
 		 579 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.12 
 
 		 641 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.6 
 
 		 634 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  37.23 
 
 		 600 aa  319  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.78 
 
 		 625 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  32.72 
 
 		 607 aa  317  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.45 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.69 
 
 		 600 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.26 
 
 		 619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.02 
 
 		 605 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  32.67 
 
 		 631 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.84 
 
 		 632 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.33 
 
 		 580 aa  313  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.22 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.22 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  38.57 
 
 		 603 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 571 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 619 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.1 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.1 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.24 
 
 		 598 aa  310  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 651 aa  310  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.77 
 
 		 614 aa  310  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.55 
 
 		 588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  33.27 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.1 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  33.02 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.92 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 575 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 637 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.77 
 
 		 627 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.52 
 
 		 571 aa  306  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.93 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.93 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.36 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.59 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.55 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  36.73 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.75 
 
 		 617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.52 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.16 
 
 		 601 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.74 
 
 		 578 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.74 
 
 		 578 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.43 
 
 		 616 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.23 
 
 		 575 aa  303  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.92 
 
 		 597 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.02 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.98 
 
 		 599 aa  302  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.92 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  30.97 
 
 		 631 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  31.4 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  31.3 
 
 		 626 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  30.27 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.29 
 
 		 556 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 601 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.22 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 585 aa  301  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.23 
 
 		 468 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.74 
 
 		 622 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 603 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.28 
 
 		 600 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.39 
 
 		 586 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>