80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2312 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  347  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  59.3 
 
 		 175 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  59.15 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  54.44 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  59.48 
 
 		 180 aa  180  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  56.07 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  55.49 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  53.41 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  56.44 
 
 		 196 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  51.25 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  51.92 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  51.88 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50.64 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  48.08 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  48.72 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  50 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  49.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.32 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  46.63 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.37 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.98 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  43.83 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  45.7 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.33 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.39 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  41.45 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.67 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  43.21 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  42.59 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  37.06 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  42.59 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  44.72 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  37.74 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.74 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  35.06 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  33.12 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  37.34 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  36.6 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  39.75 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  38.27 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.26 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  39.22 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  35.1 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  34.18 
 
 		 447 aa  95.9  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  33.11 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  45.38 
 
 		 137 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.01 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.41 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  35.03 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.1 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.46 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  29.11 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.43 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.88 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  26.45 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  28.12 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  22.45 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.01 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  35.29 
 
 		 466 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.6 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1394  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.138559  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2262  hypothetical protein  23.35 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  hitchhiker  0.00807275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  29.34 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>