20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2262 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  hitchhiker  0.00807275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1966  hypothetical protein  86.19 
 
 		 239 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.73839  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2258  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  69.23 
 
 		 211 aa  297  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000630044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  28.78 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  29.32 
 
 		 160 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.19 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  29.79 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  22.73 
 
 		 167 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  22.52 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  27.13 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  24.22 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.17 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.19 
 
 		 173 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  23.35 
 
 		 175 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  20 
 
 		 217 aa  42  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.19 
 
 		 168 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>