233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2289 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 351 aa  728    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  73.07 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  70.64 
 
 		 352 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  70.25 
 
 		 352 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  71.65 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  68.06 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  66.97 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  69.21 
 
 		 349 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  68.2 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  68.1 
 
 		 372 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  61.88 
 
 		 348 aa  454  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  60.86 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  56.34 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  54.12 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  49.27 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  50.46 
 
 		 353 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  46.71 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  46.71 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  46.39 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  46.08 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  47.02 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  45.03 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  44.38 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  45.38 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  46.2 
 
 		 366 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  45.37 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  41.35 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  40.52 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  43.52 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  41.35 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.94 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.35 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.65 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  42.02 
 
 		 336 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  42.02 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.7 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  40.41 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  40 
 
 		 335 aa  246  6e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.37 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  39.81 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.63 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.36 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  39.54 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.83 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  36.89 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  40.74 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  39.32 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  40.25 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.25 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  37.31 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  35.96 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  35.67 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  38.72 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  37.42 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  40.75 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>