More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0414 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
192 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  55.15 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.73 
 
 
196 aa  187  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.47 
 
 
199 aa  184  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.74 
 
 
197 aa  174  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.55 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.52 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
541 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.64 
 
 
196 aa  167  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.91 
 
 
194 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
201 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.64 
 
 
196 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
200 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
200 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
200 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.5 
 
 
203 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  32.5 
 
 
203 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.58 
 
 
199 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.82 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
199 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
200 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.68 
 
 
202 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
200 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
187 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.76 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.97 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.77 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.77 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
208 aa  111  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.42 
 
 
204 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.21 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
196 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
197 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
196 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
196 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.46 
 
 
202 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
193 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
206 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
201 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.53 
 
 
205 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
220 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.13 
 
 
200 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  35.84 
 
 
194 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.21 
 
 
203 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 
206 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.14 
 
 
194 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 
202 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
194 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.42 
 
 
194 aa  104  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.49 
 
 
207 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>