More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0355 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  56.67 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 177 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  56.11 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  59.66 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  53.63 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  54.19 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  54.19 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  56.74 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  54.7 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  54.14 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  52.97 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  55.11 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  53.98 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  53.18 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  53.98 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  54.12 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  52.3 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  54.24 
 
 		 175 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  48.9 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  48.62 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  47.8 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  54.29 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  48.4 
 
 		 280 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  47.22 
 
 		 238 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  46.7 
 
 		 266 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  50 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 		 250 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  45.83 
 
 		 272 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  50 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  46.77 
 
 		 266 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  47.19 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  44.21 
 
 		 267 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  48.62 
 
 		 228 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 178 aa  167  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  46.11 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  43.3 
 
 		 272 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  43.01 
 
 		 306 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  44.44 
 
 		 276 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  45.11 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  46.59 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  46.59 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  42.49 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  45.76 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  44.02 
 
 		 273 aa  160  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  47.22 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 		 174 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  42.41 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  44.62 
 
 		 277 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  41.92 
 
 		 266 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  46.02 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  47.16 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  43.5 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 		 193 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  42.94 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  44.04 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  43.5 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  42.27 
 
 		 299 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  43.1 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  43.02 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  43.02 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  44.13 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>