More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0616 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.69 
 
 
199 aa  201  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  50.25 
 
 
194 aa  192  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.73 
 
 
192 aa  187  6e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.5 
 
 
197 aa  187  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
201 aa  178  5e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.19135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.96 
 
 
196 aa  177  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  2e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  2e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.74115e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.36229e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.11786e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
541 aa  172  3e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9576e-05 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  172  3e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.96 
 
 
196 aa  172  4e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
205 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 
200 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
200 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
200 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.65 
 
 
194 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
201 aa  118  5e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
201 aa  117  8e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
196 aa  114  9e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.39698e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
196 aa  113  1e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
196 aa  113  1e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
196 aa  113  1e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
208 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.5 
 
 
199 aa  112  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.86 
 
 
202 aa  111  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
200 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
200 aa  110  1e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
199 aa  110  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.58 
 
 
214 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.78 
 
 
198 aa  108  4e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
208 aa  108  4e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.67 
 
 
194 aa  108  4e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  108  7e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  108  7e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  107  9e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  107  9e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.14 
 
 
200 aa  107  9e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  107  9e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
199 aa  107  9e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  107  9e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  107  9e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
199 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
200 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  31.34 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.38953e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  31.34 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
198 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
204 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
204 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
199 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.83401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
205 aa  104  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
205 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.41 
 
 
205 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.84 
 
 
189 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
206 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  33.5 
 
 
196 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.46819e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.15 
 
 
199 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.6322e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
203 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.77 
 
 
209 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.23 
 
 
206 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.65 
 
 
207 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
223 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
196 aa  102  5e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.65 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
197 aa  101  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
195 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.46 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  8.69116e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.76513e-06  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.36908e-05  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.51 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.61 
 
 
206 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.77 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.99 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 
188 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.39 
 
 
211 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.25 
 
 
202 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>