86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2601 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  100 
 
 		 282 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  57.63 
 
 		 278 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  59.16 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  57.63 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  53.61 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  54.07 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  55.81 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  53.22 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  41.06 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  33.96 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  39.23 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  41.26 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  39.15 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  42.95 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  36.73 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  32.6 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  30.54 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  30.86 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  29.71 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  29.56 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  28.87 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  27.91 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  28.39 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  32.53 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  26.85 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  30.7 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  30.52 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  27.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  33 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  27.42 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  32.43 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  35.46 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  30.65 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  31.69 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.95 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  34.96 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  30.61 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  34.96 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  34.96 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  35.25 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  34.96 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  34.96 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  30.66 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  31.56 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  35 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  32.8 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  29.49 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  22.53 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  37.23 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  37.93 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  33.68 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  25.44 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  33.94 
 
 		 775 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  28.74 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  37.97 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  25.16 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  39.51 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  39.51 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  39.51 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 182 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  34.52 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  36.59 
 
 		 528 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4169  Abortive infection protein  33.12 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  25.14 
 
 		 285 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5069  abortive infection protein  24.54 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  34.52 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.97 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  27.84 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  32.26 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  32.1 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  36.59 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  22.93 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  30 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>