38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1991 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  71.04 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  65.38 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  44.98 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  43.82 
 
 		 287 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  39.73 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  37.63 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  33.68 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  34.04 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  51.94 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  34.12 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  29.75 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  40.57 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.57 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  38.02 
 
 		 158 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  43.53 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  39.37 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  26.95 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  31.98 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  22.22 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0824  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  23.61 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  32.67 
 
 		 112 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  35 
 
 		 163 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  35 
 
 		 163 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  35 
 
 		 163 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  23.26 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  24.11 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  33.67 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  31 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  30.83 
 
 		 160 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  30.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>