47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1809 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1532    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  42.22 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  41.96 
 
 		 404 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  38.35 
 
 		 458 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  44 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  40.66 
 
 		 488 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  43.59 
 
 		 412 aa  138  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  38.68 
 
 		 427 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  43.11 
 
 		 426 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  43.11 
 
 		 426 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  41.89 
 
 		 415 aa  124  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  39.44 
 
 		 416 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  23.81 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  30.7 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  30.34 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  36.02 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  30.74 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  29.38 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  30.83 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  31.74 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  31.14 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  31.35 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  26.7 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  27.11 
 
 		 389 aa  62  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  31.54 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  31.87 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  27.59 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.1 
 
 		 420 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  29.03 
 
 		 420 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  32.2 
 
 		 459 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  29.05 
 
 		 401 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  24.64 
 
 		 394 aa  51.6  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  25.13 
 
 		 405 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  29.07 
 
 		 390 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  26.05 
 
 		 435 aa  50.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  32.08 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  28.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  25.13 
 
 		 405 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  30.53 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  39.29 
 
 		 426 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  30.15 
 
 		 436 aa  47.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  29.95 
 
 		 405 aa  47.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  28.67 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  32.68 
 
 		 415 aa  45.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  22.96 
 
 		 536 aa  44.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  24.47 
 
 		 390 aa  44.3  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>