More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0390 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
397 aa  803  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  63.59 
 
 
388 aa  470  1e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  61.7 
 
 
386 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  64.27 
 
 
387 aa  461  1e-128  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  60.98 
 
 
378 aa  454  1e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.76131e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  56.96 
 
 
378 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  60.88 
 
 
398 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  58.91 
 
 
413 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  55.16 
 
 
397 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  57.04 
 
 
409 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  56.15 
 
 
396 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  56.89 
 
 
398 aa  399  1e-110  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  52.54 
 
 
419 aa  399  1e-110  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  55.87 
 
 
389 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  55.22 
 
 
409 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  52.56 
 
 
398 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  51.79 
 
 
403 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  52.58 
 
 
418 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  50.52 
 
 
387 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  47.06 
 
 
387 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  50.52 
 
 
387 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  50.13 
 
 
379 aa  346  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  43.9 
 
 
385 aa  338  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  46.34 
 
 
387 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  42.31 
 
 
396 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  45.31 
 
 
382 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  44.56 
 
 
388 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  43.98 
 
 
371 aa  286  6e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  43.04 
 
 
376 aa  280  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  1.19616e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  42.97 
 
 
378 aa  275  1e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  38.7 
 
 
390 aa  272  8e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 
386 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  43.24 
 
 
369 aa  270  3e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  39.69 
 
 
385 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 
377 aa  268  9e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  41.69 
 
 
359 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
393 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  40.76 
 
 
386 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  41.03 
 
 
390 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  37.33 
 
 
376 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  34.46 
 
 
378 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 
359 aa  223  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
388 aa  223  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  35.47 
 
 
371 aa  221  2e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 
376 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  35.2 
 
 
371 aa  219  8e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 
373 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 
394 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
376 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
377 aa  215  1e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  38.08 
 
 
396 aa  215  1e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 
377 aa  214  2e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.76 
 
 
377 aa  214  2e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  33.76 
 
 
377 aa  214  3e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  37.03 
 
 
395 aa  213  4e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
377 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  37.34 
 
 
373 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  35.53 
 
 
382 aa  201  2e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 
371 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 
371 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 
391 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 
377 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  35.75 
 
 
372 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.86 
 
 
382 aa  182  8e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
388 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
398 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.9 
 
 
369 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
380 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  35.01 
 
 
367 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  34.46 
 
 
367 aa  174  2e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
374 aa  175  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
389 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
409 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  36.43 
 
 
366 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
381 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
389 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
381 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  35.17 
 
 
393 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
374 aa  166  6e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 
372 aa  165  1e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
384 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
380 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
397 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
384 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
382 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.82 
 
 
386 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
385 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
383 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
377 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
383 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 
349 aa  148  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 
382 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
392 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  36.96 
 
 
381 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
378 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
384 aa  139  8e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
382 aa  139  9e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  35.22 
 
 
383 aa  135  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
394 aa  135  2e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
387 aa  133  4e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>