More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0221 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
152 aa  304  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  78.95 
 
 
152 aa  244  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  73.03 
 
 
160 aa  227  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 
157 aa  174  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.8 
 
 
151 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 
157 aa  127  8e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.96177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 
157 aa  125  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
153 aa  125  2e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
153 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 
160 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
170 aa  119  1e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
158 aa  118  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
151 aa  119  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
163 aa  119  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
163 aa  119  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
149 aa  118  4e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
163 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  39.58 
 
 
151 aa  116  8e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
145 aa  114  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
154 aa  112  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 
144 aa  112  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
149 aa  112  2e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
162 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
158 aa  110  7e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
151 aa  110  8e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 
152 aa  110  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
163 aa  109  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  40.69 
 
 
164 aa  109  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  40.69 
 
 
164 aa  109  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
153 aa  109  1e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  43.17 
 
 
162 aa  110  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 
158 aa  109  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
151 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
141 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
162 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  6.71119e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
163 aa  107  4e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
163 aa  107  4e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
163 aa  107  4e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
161 aa  108  4e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
151 aa  107  7e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  107  8e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 
150 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
173 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 
150 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  41.73 
 
 
162 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
165 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
148 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  39.13 
 
 
152 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
156 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
168 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
159 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
167 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
173 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
150 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
149 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
149 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
149 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
149 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
145 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
165 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
153 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.15 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  40.29 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  6.65736e-08 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
145 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  35.71 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.06 
 
 
187 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  40.77 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
165 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  30.37 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  33.95 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  33.95 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.30388e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.95 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.26746e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
174 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>