More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0727 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  47.83 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.2 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  39.33 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  42.03 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.67 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  36.36 
 
 		 336 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  42.19 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  42.19 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 349 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.03 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.44 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  47.69 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  47.69 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.67 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  30.95 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  40.62 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>