290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0064 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 315 aa  610  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  56.76 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  52.22 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  50.94 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  51.58 
 
 		 328 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  51.1 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.31 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  46.25 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  41.3 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  41.27 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  43.23 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  43.22 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.84 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  36.27 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  40.88 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  43.23 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  35.09 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  38.7 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  38.1 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  33.57 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  34.93 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  41.57 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  35.96 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  42.05 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  38.72 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.86 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.55 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  41.16 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  41.16 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  41.16 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  36.36 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  41.12 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  38.28 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.11 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.92 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  37.33 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  29.46 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  38.93 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  37.93 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.55 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.76 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  36.8 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.25 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  37.93 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.15 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  35.38 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.47 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  38 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  39 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.12 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  37.89 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  35.4 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  38.61 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  37.04 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  35.81 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.3 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  41.38 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>