More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1775 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
473 aa  936    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  68.28 
 
 
461 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.36 
 
 
505 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.33 
 
 
489 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.9 
 
 
478 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.73 
 
 
478 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  40.84 
 
 
464 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.81 
 
 
479 aa  293  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  40.31 
 
 
464 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
480 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.72 
 
 
490 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
464 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.89 
 
 
521 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  39.15 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.27 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  41.37 
 
 
474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.64 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  39.44 
 
 
457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  39.15 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.74 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  39.21 
 
 
457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  39.03 
 
 
457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  38.68 
 
 
485 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1756  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.51 
 
 
250 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  39.59 
 
 
457 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  38.98 
 
 
457 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  38.98 
 
 
459 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  37.81 
 
 
472 aa  279  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  39.59 
 
 
457 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  38.75 
 
 
457 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1944  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  61.9 
 
 
254 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.63 
 
 
481 aa  279  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.54 
 
 
485 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.48 
 
 
462 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.99 
 
 
493 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.69 
 
 
462 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.18 
 
 
257 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350312  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  36.24 
 
 
468 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  39.13 
 
 
457 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  38.9 
 
 
457 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  38.85 
 
 
459 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0595  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.47 
 
 
254 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.24 
 
 
510 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  38.62 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.47 
 
 
472 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.37 
 
 
482 aa  273  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.7 
 
 
475 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
485 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.89 
 
 
502 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
485 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.13 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  35.91 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  37.67 
 
 
473 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  37.67 
 
 
473 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  37.95 
 
 
470 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.25 
 
 
480 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  38.88 
 
 
467 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  39.78 
 
 
477 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  42.32 
 
 
464 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.03 
 
 
480 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.59 
 
 
458 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.96 
 
 
473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.8 
 
 
463 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.84 
 
 
463 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.84 
 
 
463 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.65 
 
 
479 aa  259  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.39 
 
 
476 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.17 
 
 
464 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.6 
 
 
487 aa  256  7e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  39.57 
 
 
478 aa  256  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.6 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1933  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
499 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.287576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.83 
 
 
478 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.79 
 
 
507 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.36 
 
 
464 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.67 
 
 
528 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.3 
 
 
480 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.73 
 
 
472 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  36.73 
 
 
472 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.13 
 
 
478 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  36.73 
 
 
472 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.78 
 
 
495 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.87 
 
 
478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.76 
 
 
476 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  38.11 
 
 
493 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.03 
 
 
473 aa  242  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.45 
 
 
554 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.09 
 
 
478 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3750  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
497 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592413  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.89 
 
 
484 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.63 
 
 
476 aa  236  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.22 
 
 
490 aa  236  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.04 
 
 
476 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.9 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
277 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>