More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1228 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  74.4 
 
 
414 aa  651    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.71 
 
 
414 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
415 aa  847    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.95 
 
 
414 aa  630  1e-179  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.61 
 
 
425 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.83 
 
 
406 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  56.05 
 
 
408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.49 
 
 
406 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  50 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  50 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  50 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.51 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  50 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.51 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.51 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.97 
 
 
406 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.8 
 
 
414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  49.26 
 
 
406 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.26 
 
 
406 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  49.26 
 
 
406 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.11 
 
 
414 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  51.24 
 
 
420 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.67 
 
 
451 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.84 
 
 
410 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  49.75 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.07 
 
 
433 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  51.24 
 
 
414 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.49 
 
 
412 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  48.89 
 
 
420 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.67 
 
 
417 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.56 
 
 
419 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.3 
 
 
418 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
411 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
420 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.04 
 
 
419 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.11 
 
 
412 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  49.4 
 
 
419 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.29 
 
 
423 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.77 
 
 
408 aa  419  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
420 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.16 
 
 
409 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  48.22 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 
414 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.25 
 
 
419 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.49 
 
 
412 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.03 
 
 
429 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.03 
 
 
429 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 
429 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.67 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.54 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.34 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  47.24 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  48.64 
 
 
404 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.29 
 
 
404 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 
435 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.9 
 
 
413 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.71 
 
 
419 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
425 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.86 
 
 
443 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.04 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.99 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  46.8 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.88 
 
 
404 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  47.17 
 
 
414 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  46.06 
 
 
410 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  46.44 
 
 
420 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.6 
 
 
442 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 
418 aa  398  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.9 
 
 
414 aa  396  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.25 
 
 
421 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.71 
 
 
428 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.06 
 
 
414 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.98 
 
 
441 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  46.31 
 
 
414 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  46.24 
 
 
429 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 
406 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.61 
 
 
425 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.28 
 
 
419 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.83 
 
 
408 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.16 
 
 
413 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.91 
 
 
413 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  47.03 
 
 
405 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  45.2 
 
 
429 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  46.31 
 
 
414 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  48.4 
 
 
405 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.52 
 
 
404 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.24 
 
 
421 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  47.42 
 
 
416 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.91 
 
 
413 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  47.38 
 
 
417 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 
407 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  45.57 
 
 
412 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
409 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.41 
 
 
415 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.49 
 
 
416 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.6 
 
 
414 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.16 
 
 
406 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.3 
 
 
443 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>