More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1226 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
163 aa  333  5.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  85.29 
 
 
143 aa  239  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  80 
 
 
139 aa  227  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  78.47 
 
 
143 aa  222  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  73.76 
 
 
140 aa  204  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.17 
 
 
128 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.43 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.02 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.44 
 
 
137 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 
142 aa  103  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.5 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.82 
 
 
132 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  41.04 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  39.26 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.52 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  43.41 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.69 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.44 
 
 
128 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.35 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.17 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.23 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  38.17 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  39.68 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  36.3 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.12 
 
 
207 aa  87.8  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.35 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.35 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.72 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.3 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.76 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.59 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.59 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  33.97 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  37.69 
 
 
149 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.21 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  37.27 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.84 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.35 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.35 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  37.98 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.17 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.17 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.56 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.51 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.5 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.36 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  35 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  33.59 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.17 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.98 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.16 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  36.17 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  36.51 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  33.93 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  32.28 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.92 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.35 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.92 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.69 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.3 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  33.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  39.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  36.59 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.41 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.88 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  34.88 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  33.93 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.58 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.64 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.84 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.11 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.81 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.11 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  38.69 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.43 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.78 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  38.35 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  27.34 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  35.16 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  31.86 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  36.36 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.1 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>