More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15470 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
321 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  45.6 
 
 
321 aa  301  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
321 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
554 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  41.25 
 
 
498 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
520 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  41.3 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
120 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 
133 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.16 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  21.97 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  45.78 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  45.78 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  45.78 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  45 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3562  GntR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  49.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  35.96 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.07 
 
 
471 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  46.67 
 
 
493 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
124 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 
131 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 
146 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 
126 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  38.52 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.84 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 
129 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.68 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  37.21 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  34.71 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
496 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  46.75 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  53.12 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  41.49 
 
 
482 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  41.49 
 
 
482 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.33 
 
 
508 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
124 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 
125 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  45.68 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 
125 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.29 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
119 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
126 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
124 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
126 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
126 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
124 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 
126 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  49.25 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  35.07 
 
 
121 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>