More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5796 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5796  response regulator receiver protein  100 
 
 
138 aa  281  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
165 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
153 aa  102  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  38.69 
 
 
154 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
145 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  37.96 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  38.69 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  37.23 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
145 aa  94  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  33.82 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  33.82 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.12 
 
 
148 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.23 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  33.82 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.31 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.76 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  34.56 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
148 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.09 
 
 
146 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  36.03 
 
 
146 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
181 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  33.82 
 
 
146 aa  87  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  32.35 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.82 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  33.09 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  35.82 
 
 
151 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  33.82 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  31.85 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  31.65 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1797  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  40.19 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.29 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  34.56 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  32.85 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.56 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  31.88 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.03 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  32.09 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  32.33 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.59 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  30 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  31.88 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  29.29 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.2 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  30.6 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  34.51 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.16 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  28.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  30.2 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.37 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  28.47 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  29.71 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  30.4 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  31.88 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  33.09 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  31.39 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  32.85 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  29.1 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  29.71 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  29.23 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>