More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1319 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  64.2 
 
 
178 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  64.2 
 
 
178 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  58.24 
 
 
202 aa  217  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  63.1 
 
 
183 aa  217  9e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  63.1 
 
 
177 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  63.1 
 
 
183 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  63.1 
 
 
183 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  58.14 
 
 
174 aa  214  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  62.8 
 
 
178 aa  213  1e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  62.8 
 
 
173 aa  212  3e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  56.57 
 
 
175 aa  208  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  57.83 
 
 
182 aa  208  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.64089e-06  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  64.29 
 
 
155 aa  207  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  61.59 
 
 
173 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  61.11 
 
 
169 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
200 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  61.31 
 
 
177 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
173 aa  204  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  59.17 
 
 
238 aa  204  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  58.43 
 
 
171 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  57.63 
 
 
194 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  57.63 
 
 
194 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  60.61 
 
 
177 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.59634e-09 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  60.71 
 
 
177 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 
194 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 
171 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  60.71 
 
 
177 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  1.18732e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  60.71 
 
 
177 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 
166 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  4.66118e-05  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  59.64 
 
 
172 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  59.51 
 
 
163 aa  202  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
177 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  57.83 
 
 
219 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.73336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  60.71 
 
 
177 aa  201  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 
192 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  60 
 
 
173 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  58.62 
 
 
173 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  58.18 
 
 
182 aa  200  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  200  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  200  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  60.98 
 
 
192 aa  199  2e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 
219 aa  199  2e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 
156 aa  198  4e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
173 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 
178 aa  197  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 
173 aa  198  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 
173 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 
180 aa  196  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.76935e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  63.64 
 
 
180 aa  196  1e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 
180 aa  196  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  57.4 
 
 
225 aa  196  1e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 
176 aa  196  1e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 
173 aa  196  2e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 
176 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  62.94 
 
 
180 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  62.5 
 
 
154 aa  195  4e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 
173 aa  194  5e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  60.49 
 
 
169 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 
173 aa  193  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 
204 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  60.39 
 
 
184 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 
171 aa  192  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  59.33 
 
 
153 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  61.76 
 
 
180 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 
169 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  67.13 
 
 
146 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
179 aa  191  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  61.76 
 
 
180 aa  191  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  57.32 
 
 
173 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  61.76 
 
 
180 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 
178 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  54.88 
 
 
207 aa  190  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 
252 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  54.44 
 
 
193 aa  190  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.92532e-08  hitchhiker  5.79185e-07 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  57.96 
 
 
177 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
186 aa  188  3e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  6.90292e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
195 aa  189  3e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.20658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 
166 aa  189  3e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.2216e-07  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
195 aa  189  3e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.32272e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
195 aa  189  3e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.17232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
195 aa  189  3e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.45665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  59.09 
 
 
156 aa  189  3e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
198 aa  189  3e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
187 aa  189  3e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 
166 aa  189  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.01645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 
202 aa  189  3e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>