More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1194 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
426 aa  866  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  35.95 
 
 
445 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  32.69 
 
 
428 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  33.16 
 
 
428 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  35.36 
 
 
440 aa  215  1e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  33.89 
 
 
442 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  35.83 
 
 
428 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
446 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  32.91 
 
 
425 aa  206  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.52 
 
 
441 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  34.24 
 
 
447 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.58 
 
 
439 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.54 
 
 
442 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  31.26 
 
 
439 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  35.75 
 
 
439 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  30.53 
 
 
426 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  30.28 
 
 
426 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  31.93 
 
 
419 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  1.91252e-09 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  34.92 
 
 
434 aa  202  1e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  34.02 
 
 
440 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  35.38 
 
 
437 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  33.99 
 
 
451 aa  198  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  35.04 
 
 
439 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  32.69 
 
 
453 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  35.13 
 
 
437 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  29.87 
 
 
444 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  32.52 
 
 
446 aa  191  3e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  32.56 
 
 
454 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.15 
 
 
448 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 
448 aa  186  1e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.33 
 
 
448 aa  186  1e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 
425 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  31.23 
 
 
433 aa  183  5e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  31.75 
 
 
455 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  33.42 
 
 
441 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  31.75 
 
 
455 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.88 
 
 
437 aa  181  3e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 
437 aa  181  3e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  33.51 
 
 
459 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  35.36 
 
 
447 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  30.32 
 
 
437 aa  180  5e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  30 
 
 
438 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  32.31 
 
 
441 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 
454 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  32.95 
 
 
467 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  33.07 
 
 
424 aa  175  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  29.97 
 
 
441 aa  174  2e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 
430 aa  174  2e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  31.3 
 
 
440 aa  174  3e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.25 
 
 
423 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 
444 aa  172  7e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  32.92 
 
 
454 aa  172  7e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  29.44 
 
 
430 aa  172  7e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.3 
 
 
423 aa  172  8e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  32.9 
 
 
437 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.3 
 
 
423 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  30.5 
 
 
418 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.04 
 
 
423 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.3 
 
 
423 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  30.02 
 
 
425 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  30.5 
 
 
425 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  32.01 
 
 
440 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.65 
 
 
436 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  32.01 
 
 
440 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.81 
 
 
441 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.04 
 
 
423 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  31.59 
 
 
424 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  31.08 
 
 
430 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.55 
 
 
445 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  30.6 
 
 
475 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.57 
 
 
441 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  28.6 
 
 
425 aa  166  6e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 
439 aa  166  6e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  31.48 
 
 
445 aa  166  1e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.92 
 
 
434 aa  165  1e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  30.67 
 
 
440 aa  166  1e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  33.7 
 
 
399 aa  165  1e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  29.16 
 
 
437 aa  164  4e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
439 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  32 
 
 
446 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.2 
 
 
423 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  31.41 
 
 
422 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  33.13 
 
 
447 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  31.19 
 
 
448 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  30.88 
 
 
422 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  31.2 
 
 
423 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.2 
 
 
423 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  31.2 
 
 
423 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.2 
 
 
423 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.2 
 
 
423 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  31.71 
 
 
440 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.2 
 
 
423 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  30.83 
 
 
422 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.7 
 
 
441 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.81 
 
 
423 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  30.33 
 
 
412 aa  156  5e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  28.11 
 
 
383 aa  156  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0858982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  30.69 
 
 
423 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  30.55 
 
 
412 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.79 
 
 
384 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>