70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0061 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  40.51 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  39.13 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.73 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  27.5 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  33.77 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  39.39 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  39.73 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  41.51 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  34.72 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  41.51 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  42.31 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  32.39 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  29.49 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  31.43 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04530  phosphopantetheine-containing protein  33.78 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.832197  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  39.39 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  39.62 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  32.88 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  31.51 
 
 
76 aa  43.9  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  35.82 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0954  phosphopantetheine-binding  40.43 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.311548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.88 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  33.78 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  28.24 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.88 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  28.24 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  33.78 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  40.68 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  33.78 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  28.57 
 
 
93 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  31.17 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  30.67 
 
 
78 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  31.17 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  33.78 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  33.78 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  31.17 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  43.14 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  36 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  37.68 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  32.88 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  35.85 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4000  hypothetical protein  38 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.07 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  33.82 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  35.82 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  35.21 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.35 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  30.99 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  30.99 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  32.35 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  37.93 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  36.62 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  27.59 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  35.29 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  35.29 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  35.29 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  28.07 
 
 
94 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>