43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0058 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  77.12 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  79.66 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  36.13 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  40 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  35.83 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.71 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  28.95 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  32.22 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  36.67 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  24.74 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  30.34 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  28.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  29.03 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  27.03 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  30 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  27 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  27.17 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  27.96 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  33.66 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  29.9 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  29.9 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  31.03 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  23.71 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  23.71 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  28.26 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  25 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  28.09 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  27.93 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>