More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1967 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  69.15 
 
 
584 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  100 
 
 
588 aa  1150    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  46.36 
 
 
571 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  58.81 
 
 
690 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  39.47 
 
 
588 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  39.24 
 
 
585 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  42.22 
 
 
572 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  44.27 
 
 
591 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  37.04 
 
 
626 aa  353  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  38.63 
 
 
581 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  35.34 
 
 
603 aa  350  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  58.26 
 
 
694 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  39.4 
 
 
605 aa  350  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  41.96 
 
 
558 aa  349  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  35.36 
 
 
608 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  36.69 
 
 
711 aa  340  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  38.6 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  39.06 
 
 
586 aa  333  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  35.96 
 
 
577 aa  333  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  39.3 
 
 
574 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  38.49 
 
 
590 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  52.92 
 
 
706 aa  330  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  37.06 
 
 
620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  47.95 
 
 
708 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  39.5 
 
 
592 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  37.16 
 
 
583 aa  326  9e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  38.58 
 
 
580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  37.1 
 
 
578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  48.55 
 
 
708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  38.5 
 
 
574 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  38.37 
 
 
580 aa  320  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  37.19 
 
 
588 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  39.08 
 
 
571 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  34.33 
 
 
571 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  36.48 
 
 
711 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  35.19 
 
 
703 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  47.38 
 
 
736 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  38.24 
 
 
586 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  31.41 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  32.56 
 
 
573 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  45.24 
 
 
703 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  34.05 
 
 
703 aa  297  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  34.93 
 
 
603 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0985  sulphate transporter  48.49 
 
 
710 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.04 
 
 
584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2640  high affinity sulfate transporter (SulP)  48.02 
 
 
703 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  33.39 
 
 
597 aa  279  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  35.15 
 
 
521 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  34.21 
 
 
573 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  34.21 
 
 
570 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  35.75 
 
 
522 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  32.61 
 
 
580 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  34.96 
 
 
521 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.98 
 
 
574 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  35.35 
 
 
521 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1857  sulphate transporter  47.29 
 
 
702 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.249315  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  33.51 
 
 
570 aa  269  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.86 
 
 
560 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  33.15 
 
 
599 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.79 
 
 
730 aa  264  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  34.64 
 
 
522 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  34.45 
 
 
522 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  33.63 
 
 
578 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  35.9 
 
 
582 aa  257  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  35.49 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  35.24 
 
 
546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  36.23 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.62 
 
 
569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.62 
 
 
569 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  32.46 
 
 
568 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  34.03 
 
 
580 aa  252  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  31.71 
 
 
565 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  32.46 
 
 
568 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.88 
 
 
568 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  33.94 
 
 
575 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  32.89 
 
 
729 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  33.21 
 
 
573 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  35.16 
 
 
575 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  34.2 
 
 
588 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  35.6 
 
 
590 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  34.96 
 
 
521 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  32.34 
 
 
567 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.46 
 
 
576 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  33.76 
 
 
556 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  31.99 
 
 
620 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.91 
 
 
576 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.78 
 
 
573 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  34.35 
 
 
517 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.63 
 
 
575 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  32.4 
 
 
590 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  34.43 
 
 
566 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.83 
 
 
584 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  33.95 
 
 
569 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.74 
 
 
583 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.48 
 
 
605 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  33.57 
 
 
569 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  36.61 
 
 
601 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.09 
 
 
595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.68 
 
 
579 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2936  sulphate transporter  37.64 
 
 
508 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>