More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2640 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2640  high affinity sulfate transporter (SulP)  100 
 
 
703 aa  1394    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0985  sulphate transporter  50.07 
 
 
710 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  46.96 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1857  sulphate transporter  53.3 
 
 
702 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.249315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  46.85 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  44.25 
 
 
708 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  44.07 
 
 
736 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  44.44 
 
 
706 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  42.42 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  41.14 
 
 
703 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  50.91 
 
 
584 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  43.47 
 
 
571 aa  253  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  48.02 
 
 
588 aa  240  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  37.73 
 
 
581 aa  211  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  37.79 
 
 
626 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  35.5 
 
 
585 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  37.69 
 
 
588 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  35.5 
 
 
585 aa  194  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.39 
 
 
591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  32.74 
 
 
603 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  34.7 
 
 
605 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  33.64 
 
 
603 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  33.63 
 
 
586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  36.72 
 
 
586 aa  172  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  33.83 
 
 
570 aa  171  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  35.4 
 
 
571 aa  170  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  34.06 
 
 
608 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  35.54 
 
 
572 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  33.74 
 
 
574 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  34.26 
 
 
583 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  46.6 
 
 
577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  32.94 
 
 
570 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  33.33 
 
 
599 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  34.83 
 
 
584 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  33.53 
 
 
588 aa  163  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  34.19 
 
 
571 aa  163  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  35.24 
 
 
574 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  36.34 
 
 
558 aa  161  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  33.88 
 
 
578 aa  160  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  34.55 
 
 
703 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.78 
 
 
711 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  40.55 
 
 
521 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  32.14 
 
 
590 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  43.52 
 
 
546 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  32.43 
 
 
580 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  31.83 
 
 
573 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.43 
 
 
574 aa  153  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.23 
 
 
576 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  31.18 
 
 
597 aa  153  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  32.13 
 
 
580 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.21 
 
 
580 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.42 
 
 
575 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.96 
 
 
711 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  41.98 
 
 
522 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.75 
 
 
580 aa  150  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  33.33 
 
 
703 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  41.12 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  33.03 
 
 
592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  38.79 
 
 
517 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  32.15 
 
 
497 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  42.45 
 
 
522 aa  147  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.22 
 
 
574 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  42 
 
 
521 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  32.11 
 
 
620 aa  145  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.19 
 
 
522 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.45 
 
 
620 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  41.79 
 
 
517 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.47 
 
 
576 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  30.31 
 
 
590 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  32.32 
 
 
584 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.75 
 
 
578 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.91 
 
 
582 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  38.68 
 
 
730 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  29.5 
 
 
573 aa  137  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  32.14 
 
 
583 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  31.02 
 
 
590 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  29.3 
 
 
585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  32.42 
 
 
582 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.11 
 
 
569 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.3 
 
 
585 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.11 
 
 
569 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.67 
 
 
596 aa  134  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  31.02 
 
 
592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  38.89 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  29.3 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  29.62 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  29.62 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  27.22 
 
 
565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  29.62 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  29.62 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  40.38 
 
 
570 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.98 
 
 
585 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  29.5 
 
 
573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  30.37 
 
 
610 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  31.99 
 
 
579 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.37 
 
 
610 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.37 
 
 
610 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  38.71 
 
 
573 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  37.69 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  27.74 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>