More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2936 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2936  sulphate transporter  100 
 
 
508 aa  964    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  34.69 
 
 
711 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  33.96 
 
 
586 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  37.64 
 
 
588 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  33.72 
 
 
588 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.9 
 
 
703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  37.67 
 
 
584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  34.69 
 
 
581 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  37.9 
 
 
571 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.86 
 
 
711 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  36.18 
 
 
572 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  34.53 
 
 
574 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  31.53 
 
 
571 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.16 
 
 
626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  30.97 
 
 
703 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  32.88 
 
 
571 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.94 
 
 
585 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  33.91 
 
 
590 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.12 
 
 
730 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  34.13 
 
 
571 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.61 
 
 
605 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.68 
 
 
590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.75 
 
 
574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.95 
 
 
574 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  33.47 
 
 
578 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  32.11 
 
 
588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  29.72 
 
 
608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  30.94 
 
 
573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  33.33 
 
 
580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  31.26 
 
 
586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  27.19 
 
 
580 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  31.72 
 
 
729 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.29 
 
 
597 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  33.73 
 
 
580 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  35.44 
 
 
560 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  34.08 
 
 
605 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  30.23 
 
 
577 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.35 
 
 
573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.91 
 
 
585 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.24 
 
 
620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  30.37 
 
 
603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  29.69 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.5 
 
 
578 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.79 
 
 
583 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.77 
 
 
592 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.79 
 
 
573 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  29.67 
 
 
570 aa  156  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  30.48 
 
 
522 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  30.75 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.34 
 
 
570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.74 
 
 
583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.46 
 
 
558 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  29.01 
 
 
574 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  30.08 
 
 
576 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  29.09 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  29.88 
 
 
595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  29.52 
 
 
522 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  29.45 
 
 
521 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  33.33 
 
 
591 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  28.16 
 
 
568 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  28.16 
 
 
568 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  29.31 
 
 
573 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  28.43 
 
 
565 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  27.96 
 
 
568 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.27 
 
 
580 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  44.39 
 
 
690 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  40.81 
 
 
736 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  31.36 
 
 
517 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  29.4 
 
 
599 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.54 
 
 
579 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  29.01 
 
 
604 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  28.54 
 
 
522 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  29.34 
 
 
573 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.98 
 
 
596 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  32.21 
 
 
592 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  28.99 
 
 
521 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  29.48 
 
 
521 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  42.79 
 
 
694 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  30.08 
 
 
575 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  32.61 
 
 
590 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  28.65 
 
 
584 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  40.78 
 
 
708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  38.29 
 
 
708 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  30.77 
 
 
582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  30.92 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  34.16 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  38.1 
 
 
703 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  28.07 
 
 
570 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  30.39 
 
 
517 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  28.27 
 
 
570 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3236  sulphate transporter  30.28 
 
 
562 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  32.53 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.74 
 
 
570 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.76 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  35.01 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  32.02 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  34.07 
 
 
620 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  25.77 
 
 
566 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28.61 
 
 
567 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  32.13 
 
 
698 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>