More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3651 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 641 aa  1309    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  59.31 
 
 		 646 aa  740    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  58.98 
 
 		 659 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  58.09 
 
 		 659 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.94 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  41.19 
 
 		 707 aa  416  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.95 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.11 
 
 		 755 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.72 
 
 		 715 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.48 
 
 		 730 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.48 
 
 		 730 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  41.03 
 
 		 705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.73 
 
 		 732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  39.35 
 
 		 768 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.67 
 
 		 730 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.16 
 
 		 725 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.14 
 
 		 737 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  39.94 
 
 		 759 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.67 
 
 		 694 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.78 
 
 		 751 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  40.06 
 
 		 779 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.99 
 
 		 718 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.93 
 
 		 741 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  38.15 
 
 		 678 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.62 
 
 		 751 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.39 
 
 		 756 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  38.85 
 
 		 739 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.02 
 
 		 747 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.77 
 
 		 753 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.87 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  38.02 
 
 		 753 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  38.02 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.45 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.02 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.65 
 
 		 829 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.2 
 
 		 737 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 		 751 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.87 
 
 		 747 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.17 
 
 		 785 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.02 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.71 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.62 
 
 		 753 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.78 
 
 		 736 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.99 
 
 		 795 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.43 
 
 		 794 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.42 
 
 		 786 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  41.1 
 
 		 742 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  38.18 
 
 		 728 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.89 
 
 		 763 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 678 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.5 
 
 		 781 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.5 
 
 		 781 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  38.5 
 
 		 760 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.39 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  37.46 
 
 		 738 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.46 
 
 		 738 aa  375  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  39.78 
 
 		 746 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  35.54 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  36.75 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  37.12 
 
 		 762 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 		 735 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.13 
 
 		 762 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.79 
 
 		 768 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  40.09 
 
 		 726 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 		 816 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  36.91 
 
 		 678 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.43 
 
 		 772 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  39.57 
 
 		 706 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 738 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.42 
 
 		 765 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  36.01 
 
 		 816 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  38.78 
 
 		 657 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  39.44 
 
 		 790 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  39.65 
 
 		 735 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 731 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.19 
 
 		 876 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  36.45 
 
 		 749 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.58 
 
 		 763 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  37.1 
 
 		 678 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  36.18 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.43 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.02 
 
 		 855 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.85 
 
 		 662 aa  369  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.4 
 
 		 772 aa  368  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.7 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.03 
 
 		 817 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  36.89 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.61 
 
 		 833 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  36.97 
 
 		 825 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.25 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  35.66 
 
 		 625 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.01 
 
 		 1023 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  37.19 
 
 		 672 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.52 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 		 754 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.05 
 
 		 741 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.56 
 
 		 768 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  35.61 
 
 		 864 aa  365  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>