More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0089 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  60.18 
 
 
241 aa  278  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  52.97 
 
 
263 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  55.71 
 
 
263 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  9.71836e-05  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  46.99 
 
 
280 aa  225  5e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  41.96 
 
 
267 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  47.98 
 
 
236 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  46.71 
 
 
426 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  43.1 
 
 
470 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  43.2 
 
 
469 aa  153  3e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  33.61 
 
 
267 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  33.61 
 
 
267 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  33.61 
 
 
267 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  33.61 
 
 
267 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  35.4 
 
 
247 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  33.61 
 
 
263 aa  115  9e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  46.55 
 
 
275 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  29.73 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  35.62 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  30.54 
 
 
261 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  36.9 
 
 
241 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  36.2 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  31.7 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  31.68 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  39.02 
 
 
188 aa  90.1  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  4.06909e-08  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  30.45 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  38.18 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  38.6 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  31.07 
 
 
312 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  31.07 
 
 
312 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  31.07 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  30.68 
 
 
312 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.73374e-05  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  30.68 
 
 
312 aa  84.7  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  4.10016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  30.51 
 
 
312 aa  84.7  1e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  30.51 
 
 
312 aa  84.7  1e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  30.51 
 
 
312 aa  84.7  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  30.51 
 
 
312 aa  84.7  1e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  31.07 
 
 
259 aa  84.3  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  31.07 
 
 
259 aa  84.3  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  33.33 
 
 
247 aa  83.2  4e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  30.64 
 
 
257 aa  82.8  5e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  29.94 
 
 
312 aa  82.8  5e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  28.74 
 
 
276 aa  81.6  1e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  28.74 
 
 
276 aa  82  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  35.45 
 
 
312 aa  81.3  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  33.33 
 
 
299 aa  81.3  1e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  1.15155e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  80.9  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  80.9  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  36.44 
 
 
293 aa  80.5  3e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  35.34 
 
 
280 aa  80.1  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.58381e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
311 aa  79  8e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  28.65 
 
 
260 aa  78.6  9e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  33.06 
 
 
311 aa  78.2  1e-13  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  32.37 
 
 
264 aa  77.8  2e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  33.04 
 
 
315 aa  77.4  2e-13  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  35.9 
 
 
230 aa  77  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  30.92 
 
 
293 aa  77  3e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  28.25 
 
 
311 aa  76.6  4e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  25.97 
 
 
306 aa  76.6  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  25.97 
 
 
306 aa  76.6  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  25.17 
 
 
245 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  25.17 
 
 
245 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  25.17 
 
 
245 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  25.17 
 
 
245 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  30.98 
 
 
264 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  25.17 
 
 
245 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  27.27 
 
 
319 aa  74.7  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  26.34 
 
 
249 aa  73.9  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.63404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.05827e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.47783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.80442e-06  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.85217e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  37.19 
 
 
211 aa  73.6  3e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  8.82358e-08 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  5.34515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.00612e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  24.5 
 
 
245 aa  73.2  4e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.77661e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  72  9e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  25.16 
 
 
257 aa  71.6  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  35.04 
 
 
300 aa  71.6  1e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  24.58 
 
 
348 aa  70.9  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  29.84 
 
 
306 aa  70.9  2e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  25.69 
 
 
260 aa  70.9  2e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  28.95 
 
 
249 aa  70.1  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  1.57316e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  28.95 
 
 
249 aa  70.1  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  8.20302e-07 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  34.43 
 
 
234 aa  70.5  3e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  3.1305e-05 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  30.46 
 
 
313 aa  69.7  5e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.18645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  24.31 
 
 
306 aa  69.3  6e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  26.98 
 
 
249 aa  68.9  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  32.65 
 
 
250 aa  68.2  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  28.37 
 
 
347 aa  68.2  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  26.64 
 
 
327 aa  68.6  1e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  35.1 
 
 
278 aa  68.6  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  26.87 
 
 
337 aa  67.4  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  32.79 
 
 
268 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  29.15 
 
 
297 aa  66.6  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  31.4 
 
 
275 aa  66.6  4e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  32.84 
 
 
267 aa  66.2  5e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>