243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0552 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  41.33 
 
 
242 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  26.53 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  25.62 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  24.47 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  24.11 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  24.11 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  31.28 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  30.22 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  29.9 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  28.78 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  25.84 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  30.88 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  29.2 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  28.19 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  27.23 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.64 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  29.27 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  27.61 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  29.13 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  28.33 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  39.47 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  23.85 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  27.62 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  27.8 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  25.79 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  29.17 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  32.88 
 
 
188 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  27.44 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  29.72 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  24.54 
 
 
257 aa  56.6  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  26.06 
 
 
257 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  26.15 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  25.82 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  32.17 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  22.86 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  22.08 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  28.57 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  28.57 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  29.17 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  23.93 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  28.45 
 
 
245 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  29.7 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  24.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  26.34 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  29.41 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  28.45 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  28.45 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  23.81 
 
 
469 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  27.97 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  24.87 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  24.87 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  28.23 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  24.81 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01936  hypothetical protein  30.83 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06056  hypothetical protein  30.83 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  30.43 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00183  transposase  30.83 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06962  hypothetical protein  30.83 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  30.43 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  25.59 
 
 
247 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  30.7 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.97 
 
 
470 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  25.56 
 
 
230 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  24.54 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  26.47 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  26.05 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  26.05 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  26.47 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  29.06 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  25.9 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  30.58 
 
 
539 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  25.9 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  29.06 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2958  DNA replication protein-like protein  25.41 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  30.51 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  26.56 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  31.3 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>