83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0821 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  100 
 
 		 344 aa  719    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  70.73 
 
 		 337 aa  508  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  53.35 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  49.44 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  29.86 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  26.24 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  22.7 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  27.51 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  23.76 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.84 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  23.58 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  20.42 
 
 		 308 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  20.81 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  26.99 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 615 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 671 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 		 722 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  31.08 
 
 		 674 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  22.02 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  21.77 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  27.89 
 
 		 620 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.66 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 		 970 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  21.18 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  27.55 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  28.65 
 
 		 624 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  21.67 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  24.46 
 
 		 656 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  21.27 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  29.2 
 
 		 754 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.81 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  21.9 
 
 		 237 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  22.54 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  21.65 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.87 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  28.11 
 
 		 658 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>