70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4454 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  43.97 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  47.58 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  44.3 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  44.79 
 
 		 423 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  44.22 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  43.82 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  41.56 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  37.7 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  42.09 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  42.97 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  41.05 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  42.66 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  39.15 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  40.21 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  40.62 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  38.82 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  46.83 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  38.11 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  37.43 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  31.59 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  35.98 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  34.65 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  36.32 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  34.65 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  34.76 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  38.71 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  35.26 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  33.41 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  34.13 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  34.32 
 
 		 487 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  33.82 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  28.71 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  33.53 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  32.83 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  26.98 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.81 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.69 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.08 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.51 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  45.28 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  27.44 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.26 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  24.59 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.48 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.52 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.65 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  20.34 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0349  ribosomal L11 methyltransferase  53.7 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.48 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  48.44 
 
 		 200 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  48.28 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.41 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  25 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  31.13 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.28 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  45.9 
 
 		 195 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  40.43 
 
 		 198 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0431  hypothetical protein  35.53 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  40 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  52.63 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 209 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  41.03 
 
 		 200 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  35.58 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 301 aa  43.1  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  37.8 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  36.54 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3969  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  46.3 
 
 		 324 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272909  hitchhiker  0.00294439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  37.72 
 
 		 578 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>