144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1188 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  100 
 
 
403 aa  828    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  51.62 
 
 
360 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  54.39 
 
 
375 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  52.57 
 
 
354 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  52.44 
 
 
342 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  48.71 
 
 
350 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  48.4 
 
 
341 aa  316  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  48.26 
 
 
347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  49 
 
 
347 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  47.09 
 
 
347 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  48.88 
 
 
353 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  47.7 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  48.03 
 
 
351 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  43.59 
 
 
357 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  46.67 
 
 
348 aa  285  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  43.7 
 
 
349 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  49.83 
 
 
547 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  40.23 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  41.82 
 
 
356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  48.47 
 
 
430 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  60.94 
 
 
207 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  39.61 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 
556 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  48.39 
 
 
556 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  48.39 
 
 
556 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  47.98 
 
 
556 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  47.7 
 
 
274 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  40.69 
 
 
565 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  42.25 
 
 
554 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  42.25 
 
 
549 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  43.92 
 
 
566 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  42.86 
 
 
556 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  43.92 
 
 
566 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  42.86 
 
 
554 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  42.2 
 
 
552 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  42.2 
 
 
547 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  42.48 
 
 
591 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  43.14 
 
 
566 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  39.87 
 
 
549 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  43.53 
 
 
566 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  43.53 
 
 
566 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  42.11 
 
 
591 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  42.11 
 
 
591 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  42.75 
 
 
566 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  42.75 
 
 
566 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  42.35 
 
 
566 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  42.35 
 
 
566 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  41.73 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  41.96 
 
 
566 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  39.66 
 
 
546 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  43.03 
 
 
509 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  43.03 
 
 
509 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  41.18 
 
 
532 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  41.43 
 
 
507 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  35.16 
 
 
1031 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  38.28 
 
 
1017 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  27.89 
 
 
984 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.01 
 
 
1154 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  29.2 
 
 
924 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  31.14 
 
 
565 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  29.62 
 
 
565 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  30 
 
 
568 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  29.62 
 
 
565 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  30.03 
 
 
527 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  30 
 
 
565 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  29.62 
 
 
565 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  29.23 
 
 
565 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  29.23 
 
 
565 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  35.98 
 
 
775 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  34.45 
 
 
780 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  34.6 
 
 
499 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  35.07 
 
 
485 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  31.83 
 
 
565 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  35.11 
 
 
759 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  34.75 
 
 
558 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  38.78 
 
 
558 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  29.03 
 
 
565 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  29.03 
 
 
565 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  29.03 
 
 
565 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  31.49 
 
 
565 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  31.49 
 
 
565 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  41.32 
 
 
777 aa  99.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  27.86 
 
 
890 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
565 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
565 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
585 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
585 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
585 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  31.14 
 
 
565 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  33.47 
 
 
221 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  35.24 
 
 
778 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  35.24 
 
 
778 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  35.24 
 
 
778 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  30.63 
 
 
673 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  35.24 
 
 
778 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  32.9 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  29.23 
 
 
567 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  29.23 
 
 
567 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  32.46 
 
 
500 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  29.62 
 
 
567 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>