More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0853 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  83.96 
 
 		 106 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  68.22 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  73.58 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  73.26 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  62.26 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  51.28 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  47 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  49.51 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 117 aa  91.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  46.99 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  46.99 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  45.56 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  51.28 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  46.46 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  45.16 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  46.91 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  50.57 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.94 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  36.94 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.59 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  47.44 
 
 		 119 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  45.92 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  49.37 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  43.9 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  49.37 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  49.38 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  41.03 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  44.9 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  45.92 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  54.67 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  49.35 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  49.35 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  43.56 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  44.23 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  46.34 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  48.05 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  41.58 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  41.38 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>