More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2830 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  64.12 
 
 
190 aa  231  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  68.12 
 
 
199 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.13319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  60.25 
 
 
200 aa  197  8e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  54.79 
 
 
188 aa  196  2e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  54.05 
 
 
186 aa  193  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  63.24 
 
 
189 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  52.86 
 
 
198 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  48.54 
 
 
189 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.76 
 
 
213 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.68 
 
 
211 aa  127  1e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.45 
 
 
192 aa  127  1e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  41.03 
 
 
204 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
222 aa  124  8e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  42.41 
 
 
210 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  42.39 
 
 
181 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
192 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 
212 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  43.62 
 
 
188 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.92 
 
 
208 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 
200 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 
195 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 
192 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.4 
 
 
198 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.43 
 
 
195 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  39.18 
 
 
195 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  41.77 
 
 
194 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  1e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 
199 aa  120  1e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
188 aa  120  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 
198 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  44.44 
 
 
244 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 
199 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.75 
 
 
260 aa  118  4e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  39.33 
 
 
190 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.60031e-07  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  39.04 
 
 
217 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 
206 aa  117  8e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 
208 aa  116  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 
195 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  40 
 
 
205 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  38.73 
 
 
184 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  37.13 
 
 
195 aa  114  8e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  37.36 
 
 
198 aa  114  8e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  44.3 
 
 
207 aa  114  8e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
213 aa  114  1e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 
210 aa  112  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 
206 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 
210 aa  112  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 
194 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
222 aa  112  4e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  37.99 
 
 
185 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  37.99 
 
 
185 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.76 
 
 
194 aa  110  8e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
200 aa  110  1e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
192 aa  110  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.64467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  40.59 
 
 
210 aa  110  1e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.19 
 
 
185 aa  110  1e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  39.43 
 
 
203 aa  110  1e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
192 aa  110  1e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.14 
 
 
228 aa  110  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 
191 aa  110  1e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
192 aa  110  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.65498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 
206 aa  109  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 
204 aa  109  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  39.53 
 
 
242 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  39.1 
 
 
224 aa  109  2e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.37606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  37.89 
 
 
206 aa  109  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 
230 aa  109  2e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 
230 aa  109  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  38.46 
 
 
221 aa  109  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
206 aa  109  2e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  39.57 
 
 
187 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 
201 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  38.29 
 
 
189 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  37.37 
 
 
203 aa  108  4e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.89 
 
 
203 aa  108  4e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.7 
 
 
206 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  37.71 
 
 
186 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42.25 
 
 
193 aa  107  7e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
205 aa  107  8e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.95 
 
 
208 aa  107  8e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.95 
 
 
208 aa  107  8e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  37.43 
 
 
184 aa  107  9e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.48 
 
 
189 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 
195 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
201 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  38.33 
 
 
210 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  44.14 
 
 
231 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
206 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
206 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
206 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
206 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.93 
 
 
213 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 
197 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  39.86 
 
 
204 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>