More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2408 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
380 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  51.75 
 
 
369 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  48.23 
 
 
371 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  47.41 
 
 
376 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  47.96 
 
 
371 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  46.65 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  49.73 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  49.73 
 
 
382 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  49.19 
 
 
373 aa  335  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  47.62 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  44.77 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  48.67 
 
 
382 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  44.77 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  44.5 
 
 
377 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.04 
 
 
377 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  45.04 
 
 
377 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  45.04 
 
 
377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  40.48 
 
 
376 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  43.04 
 
 
388 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  40.11 
 
 
378 aa  298  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  39.73 
 
 
371 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
371 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 
372 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  36.01 
 
 
390 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  44.72 
 
 
372 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  35.83 
 
 
396 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
376 aa  233  6e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 
388 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  37.15 
 
 
419 aa  229  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  36.79 
 
 
390 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  39.44 
 
 
367 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  35.83 
 
 
387 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  36.68 
 
 
386 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 
387 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 
389 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  36.39 
 
 
367 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  34.03 
 
 
396 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 
387 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 
389 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  35.99 
 
 
395 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 
378 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
391 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 
398 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 
369 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 
394 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  34.02 
 
 
388 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  39.11 
 
 
413 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 
371 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 
378 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  34.05 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
382 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  37.12 
 
 
396 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
397 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
398 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
385 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  31.98 
 
 
359 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  34.92 
 
 
409 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
386 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
397 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 
418 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 
398 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 
366 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 
403 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
385 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
398 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
381 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
377 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
381 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
409 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
397 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
384 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
384 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 
392 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  37 
 
 
382 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 
380 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
377 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 
383 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
384 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
378 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>