More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1110 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  76.65 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  69 
 
 		 229 aa  325  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 		 226 aa  315  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  67.25 
 
 		 238 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  61.8 
 
 		 280 aa  296  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  63.11 
 
 		 238 aa  290  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  59.48 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  58.12 
 
 		 244 aa  276  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  57.26 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  58.55 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  57.51 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  58.08 
 
 		 393 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  53.04 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  52.17 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  47.01 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  47.01 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 685 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 519 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  41.57 
 
 		 527 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 		 531 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 527 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  48.71 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  44.75 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 514 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.59 
 
 		 410 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 411 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 355 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 319 aa  105  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.45 
 
 		 410 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 335 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 340 aa  99.8  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 305 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  32.27 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 304 aa  98.2  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 420 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 316 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.51 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.56 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.02 
 
 		 528 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 310 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  29.96 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 491 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 378 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.55 
 
 		 317 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 586 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  30.87 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 301 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 312 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  31.28 
 
 		 310 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.23 
 
 		 809 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 335 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 448 aa  95.5  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 283 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 		 266 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 273 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  28.76 
 
 		 502 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.68 
 
 		 382 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  31.31 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 329 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 340 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 331 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 334 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.97 
 
 		 246 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 316 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.11 
 
 		 245 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.18 
 
 		 309 aa  92.8  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>