More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1012 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  100 
 
 
213 aa  420  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  72.43 
 
 
208 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  6e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  61.02 
 
 
188 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  62.07 
 
 
192 aa  214  1e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  66.23 
 
 
198 aa  212  3e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  68.03 
 
 
192 aa  212  3e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  48.3 
 
 
208 aa  171  7e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  48.3 
 
 
208 aa  171  7e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  48.84 
 
 
210 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  45.25 
 
 
213 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  46.67 
 
 
231 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  45.56 
 
 
225 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  42.86 
 
 
190 aa  140  2e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  51.82 
 
 
204 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  51.03 
 
 
192 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  47.55 
 
 
210 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  45.22 
 
 
190 aa  135  6e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  42.26 
 
 
195 aa  134  1e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  41.11 
 
 
221 aa  133  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.24 
 
 
194 aa  132  4e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.45 
 
 
195 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  49.38 
 
 
208 aa  130  1e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  47.3 
 
 
192 aa  131  1e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 
195 aa  130  1e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.23 
 
 
226 aa  129  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  46.62 
 
 
194 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  40.21 
 
 
210 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  48.25 
 
 
207 aa  128  5e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  40.36 
 
 
189 aa  128  8e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
192 aa  127  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.65498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
192 aa  127  9e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
192 aa  127  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.64467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.16 
 
 
189 aa  127  1e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  39.18 
 
 
195 aa  127  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 
190 aa  126  2e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.60031e-07  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  42.41 
 
 
198 aa  127  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 
211 aa  126  2e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.6 
 
 
189 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
195 aa  125  4e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  39.43 
 
 
225 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  42.94 
 
 
246 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
248 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 
185 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  46.27 
 
 
189 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  43.87 
 
 
223 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  45.26 
 
 
224 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.37606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 
200 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
194 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  43.71 
 
 
286 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
212 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
178 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  39.52 
 
 
260 aa  120  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 
225 aa  120  1e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 
206 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
185 aa  120  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 
206 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.13 
 
 
206 aa  120  1e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  48.12 
 
 
200 aa  121  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 
204 aa  120  1e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 
206 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 
206 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
181 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  40.94 
 
 
184 aa  119  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 
195 aa  120  2e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
181 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
181 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 
181 aa  120  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  42.13 
 
 
203 aa  119  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 
184 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  37.36 
 
 
274 aa  120  2e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  42.13 
 
 
203 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 
189 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.57 
 
 
206 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 
185 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  39.35 
 
 
209 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
237 aa  119  4e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  34.65 
 
 
224 aa  119  4e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  34.05 
 
 
239 aa  119  4e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 
181 aa  118  5e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 
181 aa  118  5e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 
187 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  40.24 
 
 
186 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 
196 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.06874e-10  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  41.61 
 
 
181 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 
247 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 
197 aa  118  8e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  37.21 
 
 
197 aa  118  8e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  5.06013e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>