105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0555 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  100 
 
 
130 aa  260  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  89.15 
 
 
129 aa  224  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  62.5 
 
 
131 aa  163  6e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  42.59 
 
 
169 aa  115  2e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  41.98 
 
 
169 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  41.36 
 
 
169 aa  113  1e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  41.36 
 
 
169 aa  111  4e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  41.36 
 
 
170 aa  110  7e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  40.12 
 
 
169 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  9.44942e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  40.12 
 
 
170 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  39.51 
 
 
170 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.84 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  37.82 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.65233e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  35.53 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.29032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.57 
 
 
831 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  38 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  3.54849e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  38 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 
817 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  34.36 
 
 
169 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.40912e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  39.85 
 
 
140 aa  83.2  1e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  35.81 
 
 
190 aa  83.6  1e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  35.26 
 
 
160 aa  83.2  1e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  42.65 
 
 
144 aa  82.8  1e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.45 
 
 
817 aa  81.6  3e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.86256e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  34.64 
 
 
163 aa  81.6  3e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  36.57 
 
 
139 aa  81.3  4e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.33 
 
 
864 aa  80.9  6e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  80.5  7e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  36.6 
 
 
196 aa  80.5  7e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34 
 
 
820 aa  79.7  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.01829e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  32.24 
 
 
159 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.6362e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  32.24 
 
 
159 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  34.44 
 
 
191 aa  79.3  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.24979e-07  decreased coverage  3.01947e-07 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.25 
 
 
938 aa  78.6  2e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  31.61 
 
 
177 aa  78.6  3e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  35.14 
 
 
195 aa  78.6  3e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  35.95 
 
 
192 aa  78.2  4e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  32.24 
 
 
159 aa  78.2  4e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  37.75 
 
 
156 aa  78.2  4e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  1.04136e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  32.24 
 
 
159 aa  77.8  5e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  33.11 
 
 
196 aa  77.4  6e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  31.58 
 
 
159 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03933e-15 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  77.4  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  77.4  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  31.76 
 
 
210 aa  76.3  1e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  32.43 
 
 
197 aa  76.6  1e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  31.79 
 
 
158 aa  75.9  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  75.9  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  30.92 
 
 
159 aa  75.5  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.01023e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
834 aa  74.7  3e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.09 
 
 
138 aa  73.6  9e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  33.74 
 
 
207 aa  73.2  1e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  33.61 
 
 
126 aa  73.2  1e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  33.74 
 
 
175 aa  73.6  1e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  30.26 
 
 
171 aa  70.1  1e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  32.08 
 
 
200 aa  69.7  1e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.5266e-05  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 
354 aa  68.2  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 
354 aa  68.2  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  35.57 
 
 
156 aa  65.5  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  33.33 
 
 
127 aa  65.5  2e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  34.35 
 
 
143 aa  64.7  4e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 
813 aa  64.3  5e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  29.8 
 
 
356 aa  63.9  8e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  29.8 
 
 
354 aa  62.8  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  29.8 
 
 
354 aa  62.8  1e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  29.8 
 
 
354 aa  62.8  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  31.9 
 
 
203 aa  62.8  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  32.58 
 
 
193 aa  62.4  2e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  34.88 
 
 
138 aa  61.6  3e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.92 
 
 
837 aa  61.6  4e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  36.91 
 
 
155 aa  59.3  1e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  36.94 
 
 
130 aa  57.8  6e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  27.83 
 
 
120 aa  54.7  4e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  26.58 
 
 
166 aa  54.7  4e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  29.63 
 
 
116 aa  53.9  6e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  28.24 
 
 
560 aa  53.5  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  28.99 
 
 
170 aa  53.5  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  28.26 
 
 
170 aa  52.8  1e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  52  3e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.01 
 
 
133 aa  50.8  7e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  25.97 
 
 
159 aa  49.7  1e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  50.1  1e-05  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  25.58 
 
 
169 aa  48.9  3e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  26.03 
 
 
171 aa  48.5  3e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0100  hypothetical protein  28.03 
 
 
129 aa  48.1  4e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  28.46 
 
 
133 aa  48.1  4e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0092  hypothetical protein  27.27 
 
 
129 aa  47.8  5e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.741351  normal  0.223758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  26.03 
 
 
170 aa  47.8  5e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.30705e-06  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  26.17 
 
 
157 aa  47.8  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.44702e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  47.8  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.59869e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  47.4  7e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  35.21 
 
 
125 aa  47.4  7e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  2.31633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  26.67 
 
 
272 aa  47  8e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  25.93 
 
 
116 aa  47  8e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  30.48 
 
 
271 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  34 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  32.46 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.10155e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0827  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>