90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2645 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  312  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  77.56 
 
 
156 aa  221  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  77.56 
 
 
156 aa  221  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  65.68 
 
 
169 aa  219  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  85.53 
 
 
156 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  53.33 
 
 
169 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  53.94 
 
 
169 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  53.33 
 
 
169 aa  176  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  53.33 
 
 
169 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  54.32 
 
 
200 aa  174  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  50.9 
 
 
170 aa  173  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  52.1 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  66.23 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  51.81 
 
 
170 aa  170  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  51.52 
 
 
169 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  54.43 
 
 
181 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  46.39 
 
 
207 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  46.39 
 
 
175 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  53.33 
 
 
203 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  47.13 
 
 
210 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  48.39 
 
 
197 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  47.13 
 
 
196 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  47.1 
 
 
195 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  47.1 
 
 
190 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  46.15 
 
 
177 aa  138  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  44.08 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  43.51 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  38.06 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.04 
 
 
158 aa  94  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  36.99 
 
 
170 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  36.3 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  39.69 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 
831 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  36.62 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  36.11 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.9 
 
 
817 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  34.19 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  33.33 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  34.57 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  35.26 
 
 
160 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  37.58 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  30.32 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  30.32 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  34.62 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  37.58 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.21 
 
 
820 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 
817 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  32.48 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  32.48 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  32.48 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  32.48 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  32.48 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  32.48 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.18 
 
 
864 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.11 
 
 
938 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  31.85 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.59 
 
 
834 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  29.68 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  29.94 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  29.94 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.38 
 
 
813 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  29.94 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.48 
 
 
837 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  33.54 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  30.57 
 
 
356 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  31.45 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.14 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  33.55 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  31.85 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  31.85 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  29.14 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  30.5 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  32.72 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  30.32 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  24.16 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  28.22 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  27.22 
 
 
201 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  27.33 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  23.72 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0092  hypothetical protein  25.5 
 
 
129 aa  44.3  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.741351  normal  0.223758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  28.19 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  23.03 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0100  hypothetical protein  22.82 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  32.2 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000231633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>