110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2900 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  100 
 
 		 129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  89.15 
 
 		 130 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  62.5 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  41.36 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  40.74 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  40.74 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  40.74 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  39.51 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  41.36 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  39.51 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  39.51 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.87 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  43.28 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  34.21 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  37.18 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  37.33 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  37.33 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  34.97 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  33.97 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  36.49 
 
 		 190 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.21 
 
 		 831 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  35.95 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  34.07 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  32.86 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 817 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  32.05 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.46 
 
 		 817 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  30.92 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  30.92 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  30.92 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  30.92 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  34.46 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  30.92 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  31.55 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  33.78 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  30.92 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  30.92 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  33.11 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.56 
 
 		 864 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  30.26 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30 
 
 		 820 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  31.41 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  30.46 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  33.11 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  30.13 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  32.52 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  30.13 
 
 		 196 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  32.52 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 		 834 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.65 
 
 		 938 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  37.58 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.82 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  31.15 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  31.45 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  29.8 
 
 		 354 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  29.8 
 
 		 354 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 		 813 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  29.14 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.14 
 
 		 837 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  29.14 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  29.14 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  33.13 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  28.83 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  26.58 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  29.63 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  29.5 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  28.78 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  33.04 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000231633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  28.24 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  26.71 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  27.4 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  26.06 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  25.74 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  23.38 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  34.31 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  32.11 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  25.37 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  28.95 
 
 		 271 aa  48.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  27.48 
 
 		 560 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  25.22 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  33.33 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  26.92 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  26.36 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  28.07 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  28.07 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0827  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  34.92 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0092  hypothetical protein  25.38 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.741351  normal  0.223758 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>