71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0963 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  33.6 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  34.45 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  35.16 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  36.59 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  37.07 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  33.09 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  37.76 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  31.67 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  32.11 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  32.11 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  35.19 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  36.08 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  25.21 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  24.37 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  26.51 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  27.11 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  25.21 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  27.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  29.09 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  32.35 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.46 
 
 		 831 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  35.04 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  26.51 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  30.61 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  35.04 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  28.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  28.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  22.69 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  30.28 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  27.89 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  27.88 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  43.08 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  27.27 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  40 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  29.66 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.95 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  27.05 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  46.81 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  28.79 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  34.92 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  34.92 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.01 
 
 		 834 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  30.83 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  26 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.46 
 
 		 817 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.48 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  27.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  24.07 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  26.45 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  27.59 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  38.1 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  27.46 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  28.57 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>