78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1403 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  43.85 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  45.8 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  44.12 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  40.44 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  43.38 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  40.3 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  35.82 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  26.21 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  28.85 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  30.13 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  29.87 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.85 
 
 		 831 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  32.12 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  35.51 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  27.39 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  28.39 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  26.81 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.77 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2227  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2714  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000188359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2599  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.651436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3116  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.387996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  28.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  27.92 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1553  hypothetical protein  25.17 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.97 
 
 		 817 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  27.55 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  28.75 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.03 
 
 		 817 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  34.62 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  27.67 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  26.42 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2411  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  29.38 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  27.39 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.62 
 
 		 837 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  28.75 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  28.68 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  28.99 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.21 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.03 
 
 		 834 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  29.09 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  25.97 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  25.97 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  24.8 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  28.75 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  25.97 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  25.97 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  25.97 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  25.97 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.45 
 
 		 938 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  25.97 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  25.97 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  30.72 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  30.72 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  33.08 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  29.09 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  24.85 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0776  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  25.32 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.39 
 
 		 864 aa  42  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  24.57 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24 
 
 		 813 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2084  hypothetical protein  28.03 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.72 
 
 		 820 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  24.84 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  22.52 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>