100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1549 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  81.02 
 
 
143 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  58.82 
 
 
144 aa  168  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  57.35 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  51.52 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  46.32 
 
 
135 aa  120  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  47.41 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  38.52 
 
 
137 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  43.38 
 
 
149 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  36.08 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  38.85 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  36.24 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  35.33 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  37.58 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.03 
 
 
831 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  36.94 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.97 
 
 
834 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.62 
 
 
820 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 
837 aa  79.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  35.97 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  36.31 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.88 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.31 
 
 
938 aa  77.4  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  31.25 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.25 
 
 
817 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.19 
 
 
817 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  32.9 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 
864 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1553  hypothetical protein  32.45 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  33.86 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  31.85 
 
 
191 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  34.62 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  32.26 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  30.97 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  30.32 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.3 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
354 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
354 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  32.47 
 
 
354 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  32.7 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  32.7 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  29.3 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
813 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  31.58 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  35.85 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  35.85 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  32.7 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  32.7 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  31.17 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  32.58 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  31.68 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  31.11 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  29.44 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  31.01 
 
 
201 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0776  hypothetical protein  31.79 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  31.33 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  30.72 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2599  hypothetical protein  34.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.651436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3116  hypothetical protein  34.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.387996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2714  hypothetical protein  34.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000188359 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  30.97 
 
 
196 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  33.59 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2227  hypothetical protein  34.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  29.03 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  29.63 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  31.93 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  31.74 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  29.68 
 
 
210 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  31.14 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2411  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  29.3 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  30.12 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  32.2 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1474  hypothetical protein  31.2 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  31.85 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  30.57 
 
 
156 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  37.76 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  26.99 
 
 
560 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  30.72 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2084  hypothetical protein  29.63 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  26.83 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  35.16 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  55.32 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  26.11 
 
 
207 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  26.51 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  55.81 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1983  hypothetical protein  23.62 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1617  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.589663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>