24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1443 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  90.52 
 
 
116 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1322  hypothetical protein  36.28 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.070069  normal  0.542385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.71 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  24.37 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.31 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  23.23 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  25.3 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  26.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3179  hypothetical protein  27.93 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  0.169697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  27.06 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  25.88 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  23.21 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  20.35 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  24.39 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  24.17 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  22.45 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  28.77 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  28.24 
 
 
191 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  25 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>