More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2976 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  85.25 
 
 		 207 aa  327  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  77.27 
 
 		 210 aa  316  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  74.24 
 
 		 202 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  77.66 
 
 		 203 aa  297  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  77.16 
 
 		 208 aa  295  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  68.69 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  55.15 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  54.04 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  50.5 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  50 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  51.76 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  52.53 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  48.5 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  51.72 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  51.72 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  45.36 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  41.58 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  43.68 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  39.15 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  43.4 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  40.41 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  39.43 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.58 
 
 		 218 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.06 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  40.48 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.7 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  37.31 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 		 215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  39.29 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  36.45 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  35.15 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  38.58 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  35.9 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  39.01 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  37.11 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  34.65 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  36.46 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.95 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  39.25 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  37.11 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  38.59 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.98 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.46 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  37.65 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.65 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  37.65 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  35.5 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  37.65 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.65 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  37.65 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  36 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.7 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.45 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  38.95 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  39.76 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  36.51 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  38.37 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  37.13 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  44.16 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.21 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  39.41 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  34.5 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.64 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  32.64 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  34.92 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  34.62 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  34.62 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  34.62 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  34.62 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  34.07 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.87 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.47 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  33.86 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.87 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  34.91 
 
 		 325 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  34.41 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  36.25 
 
 		 232 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  33.86 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  33.86 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  34.39 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.19 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>